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茂野大吾は現役のプロ野球選手を父に持つ小学生。三船ドルフィンズで野球を始めるも、1年足らずで野球を辞めた大吾は、無気力な生活を送っていた。迎えた小学6年生の春、大吾の前にアメリカ帰りの転校生が現れる。

アメリカからやってきた転校生・佐藤光の父は、大吾の父・吾郎の盟友にして大リーグでも活躍した名捕手・佐藤寿也だった。光は「近所の野球チームに入りたい」と大吾に言うが、大吾は光に対してつれない態度を取る。

強肩強打の元メジャーリーガー・佐藤寿也の息子であり、野球の本場・アメリカから帰国したばかりの光が、早速練習試合で外野手として起用された。ところが、光は平凡な外野フライを後逸＆大暴投してしまう。

練習試合で光のずば抜けた野球センスを目の当たりにした大吾は、自らの野球の才能と引き比べ、ひとり意気消沈していた。光はそんな大吾を「君は野球が好きなんだよ」と励まし、ドルフィンズの練習に誘う。

「楽しそうだからピッチャーがやりたい」と言いだした光は、ボールの握り方もフォームもめちゃめちゃだが、目を見張る剛球の持ち主だった。光は練習相手に駆りだされた大吾に対し、バッテリーを組もうと提案し…。

母・薫の思わぬけがもあり、大吾は仕方なくバッティングセンターで速球を捕る練習を始める。その矢先、大吾の目の前に元メジャーリーガーの佐藤寿也が現れた。寿也の登場に、呆然とする大吾だったが…。

光と久しぶりにキャッチボールをした大吾は、改めてバッテリーとしての手応えを感じた。しかし、迎えた週末の練習で、急遽光が母方の実家の群馬に引っ越したことがわかり、大吾はショックを受ける。

三船小6年の佐倉睦子は、大吾のクラスメイト。小さい頃から野球が大好きだった彼女は、大吾や光が練習する姿を見て、野球をやりたい気持ちが抑えられなくなり、父の反対を押し切ってドルフィンズの一員になるが…。

夏の大会を直前に控えた練習試合でチームワークを深め、三船ドルフィンズのメンバーは少しだけ自信と手応えをつかむ。一方、群馬に転校した光は、ドルフィンズの仲間とも離れ、心の晴れない日々を送っていた。

夏の大会初戦。ドルフィンズの相手は谷川イーグルス。監督の田代は大吾を2番ライトで起用する。ところが、「親の七光り」を目の敵にするエース・卜部や永井は、大吾のスタメン起用が気に食わず、厳しい目を向ける。

谷川イーグルスとの夏の大会初戦。三船ドルフィンズは4点をリードし、試合は終盤に突入していた。エースの卜部と4番でキャッチャーのアンディは、大会を勝ち進み、東斗ボーイズにリベンジを果たすために奮闘する。

夏の大会初戦、4点リードの最終回。大吾のタイムリーエラーで同点に追いつかれた三船ドルフィンズ。意気消沈する大吾だったが、バックネット裏から声を掛けられ、目を見張る。そこには群馬から光が駆けつけていた。

光と大吾の新バッテリーの活躍もあり、1回戦を突破した三船ドルフィンズ。悲願の勝利に監督の田代は号泣して喜ぶが、負傷したアンディは全治10日と診断され、翌週の2回戦に向けてチームは不安材料を抱えることに。

夏の大会2回戦、ドルフィンズの相手は虹ヶ丘ビートルズに決まった。ビートルズのエース・玉城は、小学生離れした長身ながら山なりの超スローボールが武器。偵察した卜部は、玉城の謎めいた投球スタイルを警戒する。

小技を絡めた虹ヶ丘ビートルズのスモールベースボール。初めて先発バッテリーを組んだ卜部と大吾の隙を突かれ、ドルフィンズは初回に2点を失う。打線も封じられ、攻守に頭脳をフル回転させる大吾だったが…。

スローボールだけで緩急の差をつけ、タイミングを狂わせるビートルズ・玉城の前に凡打を重ねるドルフィンズ。キャッチャーを大吾からアンディに交代させて守備のリズムを取り戻すが、試合は終盤に差し掛かり…。
全力勝負

光の劇的な逆転満塁ホームランが飛びだし、夏の大会2回戦で難敵・ビートルズを下した三船ドルフィンズ。ところが息つく暇もなく、ドルフィンズは昼の休憩を挟んで、3回戦の本郷シャークス戦を迎えることに。

光の完封勝利で準々決勝に進出したドルフィンズ。次の相手は名門・東斗ボーイズに決まった。チームの中心選手である眉村道塁と渉の双子姉弟が放つ圧倒的な存在感に、ドルフィンズメンバーは衝撃を受ける。

ドルフィンズのエース・卜部には、野球好きの父親に鍛えられ、意気揚々と名門・東斗ボーイズに入団した過去があった。因縁の東斗ボーイズとの対決に闘志を燃やす卜部に、監督の田代から1本の電話が入り…。

夏の大会準々決勝。三船ドルフィンズは、光と大吾の先発バッテリーで強豪・東斗ボーイズに挑む。一方、東斗ボーイズは準決勝を見越してエース左腕の眉村道塁を温存、控え投手の小松を先発マウンドに送る。

幼馴染みで少年野球時代からのチームメイト・佐倉睦子と共に私立風林中に通う茂野大吾は、中学2年生の春を迎える。野球部に所属する大吾と睦子だが、部員はわずか6人で、睦子を含めた4人が女子だった。

部員わずか6人だった風林中の野球部に、強豪少年野球チーム出身の仁科たち5人の新1年生が加わり、上級生の大吾たちは気を引き締めて朝練習のグラウンドへ向かう。ところが、仁科たち1年生は大吾たちに反発し…。

新監督の就任が取り消され、1年生の男子4人はシニアリーグに進み、風林中野球部の新戦力は男子で1人残された仁科と横浜リトル出身のアニータ＆千里の3人だけとなった。こうしてギリギリ9人の部員が揃うが…。

風林中野球部が県大会の初戦を迎える朝、大吾の父・吾郎は盟友・佐藤寿也と電話で語りあっていた。風林中の初戦を気にかける寿也に、吾郎は思わぬ形でキャプテンを担うことになった大吾の半年間を思い浮かべ…。

新生・風林中野球部の大会初戦の相手は五木中学校。五木中のエース・横内は、「女子ばかりの相手になぜエースの自分が先発しなければいけないのか」と不満を隠せないまま、トップバッターの千里と対決する。

地区予選の1回戦、風林中は初回に3点を先取するが、五木中の先発・横内が封印していたスライダーをまじえてきたことで、打線は徐々に抑え込まれていく。風林中の先発・睦子も何とか五木打線をかわしていくが…。

風林中の次戦の相手は、大吾たちの小学生時代のチームメイトだった卜部とアンディを擁する清和中に。初戦で11もの盗塁を記録した清和中の機動力を目の当たりにした大吾やアニータは、盗塁対策の必要性を痛感する。

脅威の機動力を誇る清和中を封じるため、ピッチャーの睦子を中心にランナーへのけん制を入念に準備し、大吾たちは2回戦に臨む。「序盤から清和中が無謀に仕掛けてくることはない」と予測する大吾だったが…。

地区予選の2回戦、周りが見えなくなっていたキャッチャー・アニータは、ライトの仁科にミスをズバリと指摘される。小学生時代の苦い思い出を抱えていたアニータは、キャッチャー失格なのではないかと意気消沈し…。

アニータの一発で同点に追いついた風林中だったが、終盤の6回表、清和中に勝ち越しを許してしまう。さらに、そのクロスプレイでキャッチャー・アニータが手首を負傷し、レフトの大吾がマスクをかぶることに。

地区予選2回戦はついに最終回。7回表、清和中にリードを広げられるが、緊急登板した仁科が連続三振を奪い、風林中は何とかピンチを切り抜ける。そして7回裏、風林中の最後の攻撃は3番の沢から始まり…。

大吾の劇的なサヨナラヒットで、旧友の卜部&アンディを擁する難敵・清和中を破り、地区大会準決勝に駒を進めた風林中。激戦の疲れも引きずったまま、風林メンバーは他校の試合を偵察していたのだが…。

地区大会の準決勝・柳川中学校との対戦を迎える風林中。連戦のなか、負傷のアニータは6番に下がり、4番・大吾、5番・仁科とオーダーを組み替えて臨むが、先発ピッチャーには引き続き睦子が起用される。

関鳥の満塁ホームランで準決勝を制した風林中は、午後からの決勝戦に向けて慌ただしく準備を始める。もう一方の準決勝、英邦学院と大尾中学校の対戦の偵察を睦子たちに任せた大吾は、仁科の投球練習に付き合う。

部員9人で勝ち上がってきた風林中と、名門・横浜シニア勢を揃えた大尾中との地区大会決勝戦が始まった。左利きの眉村道塁がショート、出光がセカンドという布陣を目の当たりにした大吾は、大尾中の意図に気づく。

眉村道塁ら強力メンバーを擁する大尾中との決勝戦。風林中先発の仁科は、スタミナ切れと守備の乱れで3回裏に5点を失ってしまう。仁科の続投を諦め、4回から急きょセンターの千里が風林マウンドを引き継ぐ。

ノーヒットに抑えられていた風林中は、5回表に大尾中の2番手ピッチャー・出光を攻め、千里のタイムリーなどで2点を返す。だが、大尾中はリリーフに眉村道塁を投入し、太鳳を打ち取って逃げ切りを図る。

千里の後を受けて緊急登板した弥生が大尾打線を抑え込むものの、風林中の反撃も封じられ、地区大会決勝は大尾中3点リードのまま最終回に突入。7回表、風林中はツーアウトながら、1・3塁のチャンスを迎える。

風林中の起死回生の逆転劇、そして、ひじの故障を乗り越えて力投する弥生に大尾中の強力打線が襲いかかり、決勝戦は劇的な幕切れを迎える。そんな激闘を終え、自宅に戻った大吾は精根尽き果てた様子だったが…。